Понятие "территориальные органы исполнительной власти" не закреплено в конституции и законодательстве РФ. При этом, под такими органами могут пониматься:

1) территориальные органы органов федеральной исполнительной власти;

2) территориальные органы органов региональной исполнительной власти;

3) в определенной мене сюда могут быть включены и органы местного самоуправления, а также формируемые ими территориальные органы МСУ.

Территориальные органы федерального органа исполнительной власти являются государственными органами, находящимися в его подчинении. Порядок организации деятельности территориальных органов федеральных органов исполнительной власти предусматривается в регламенте соответствующего федерального органа исполнительной власти.

Образование территориального органа федерального органа исполнительной власти, а также его реорганизация или упразднение осуществляются руководителем федерального органа исполнительной власти путем принятия решения на основании схемы размещения территориальных органов. Схема размещения территориальных органов федеральных органов исполнительной власти включает их перечень, фонд оплаты труда и предельную численность работников территориальных органов каждого федерального органа исполнительной власти. В зависимости от подчинённости органов (Правительству, министерству) схема размещения территориальных органов утверждается Правительством или министерством на основе предложений руководителей федеральных служб и федеральных агентств.

Руководитель федерального органа исполнительной власти утверждает положение о территориальном органе этого федерального органа исполнительной власти.

Территориальные органы в соответствии с компетенцией федерального органа исполнительной власти и установленными полномочиями выполняют функции по контролю и надзору, по управлению государственным имуществом, по предоставлению государственных услуг и другие функции, в том числе по выполнению задач, связанных с реализацией федеральных программ, планов, отдельных мероприятий, предусмотренных актами Президента РФ, Правительства и соответствующего федерального органа исполнительной власти.

Территориальные органы в пределах своих полномочий также осуществляют контроль и надзор за выполнением органами исполнительной власти субъектов РФ переданных им в соответствии с федеральными законами полномочий федеральных органов исполнительной власти по предметам совместного ведения, а также за соблюдением требований к качеству и доступности государственных услуг организациями, через которые они оказываются.

Указом Президента РФ от 02 июля 2005 № 773 определяется порядок взаимодействия территориальных органов федеральных органов исполнительной власти и органов исполнительной власти субъектов России[137].

Согласно Указу высшее должностное лицо субъекта РФ (руководитель высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ) наделяется полномочиями по организации взаимодействия и координации деятельности органов исполнительной власти соответствующего субъекта РФ и территориальных органов Министерства внутренних дел РФ, Министерства РФ по делам гражданской обороны, чрезвычайным ситуациям и ликвидации последствий стихийных бедствий, Министерства юстиции РФ, Федеральной службы исполнения наказаний, Федеральной регистрационной службы, Федеральной службы судебных приставов, федеральных министерств и иных федеральных органов исполнительной власти, руководство которыми осуществляет Правительство РФ, федеральных служб и федеральных агентств, подведомственных этим министерствам.

До решения вопроса о кандидате на должность руководителя территориального органа федерального органа исполнительной власти федеральные министры согласовывают кандидатуру с высшим должностным лицом субъекта РФ (руководителем высшего исполнительного органа государственной власти субъекта РФ).

На окружном уровне содействие взаимодействию федеральных и региональных органов власти, проведению согласительных процедур обеспечивается Полномочным представителем Президента в Федеральном округе[138] и специальным Советом[139] при нём.

Внутренняя координация территориальных федеральных органов исполнительной власти как самостоятельная задача, была возложена на региональные коллегии федеральных органов исполнительной власти[140]. Эти совещательные органы были созданы при Полномочных представителях Президента РФ в каждом субъекте Федерации. С образованием Федеральных округов территориальные органы призваны организовать взаимодействие непосредственно на уровне федерального округа[141] с Полномочным представителем Президента РФ и его аппаратом, часть которого размещается непосредственно в субъектах Федерации и представлена в них должностью федерального инспектора. Таким образом, внешняя (с органами субъекта Федерации) и внутренняя (между собой) координация федеральных органов происходит на двух управленческих уровнях: в субъектах России и в Федеральных округах.

Установление территориальных органов в системе исполнительной власти субъектов Федерации отдельный вопрос государственного строительства. Их формирование нельзя считать общим требованием. Они создаются по мере надобности – в отдельных субъектах Федерации (Свердловская область).

По аналогии в городах и районах могут создаваться территориальные органы исполнительных органов (министерств, служб и т.п.) субъектов РФ - региональных органов. Например, в Москве как субъекте РФ создана система префектур округов Москвы, а им подчинены управы районов. Все эти органы входят в систему исполнительной власти Москвы - субъекта РФ. Аналогичная система создана и в Санкт-Петербурге.

Муниципальные образования - это сами территории, относительно небольшого размера, потому сами по себе их административно-распорядительные органы (администрации) могут быть названы территориальными. Но если мы исходим из аналогий - то территориальными органами являются администрации удаленных единиц (например, посёлков), которые не являются самостоятельными органами МСУ, подчинены местной администрации. Аналогично сюда можно отнести КТОСы и старост - новые формируемые органы МСУ с 2021-2022 гг.